自國家認監委成立以來，我國已基本建立了與國際接軌并適應我國國情的從農田到餐桌全過程管理的食品、農產品認證認可體系。食品和農產品認證已成為中國保障食品農產品質量安全，促進中國食品農產品國際貿易的重要手段。目前開展的認證活動已經在建設社會主義新農村過程中發揮了積極作用。

    一、有機產品認證

    有機農業是指按照有機農業生產標準，遵循自然規律和生態學原理，在生產中不采用基因工程獲得的生物及其制品，不使用化學合成的農藥、化肥、生長調節劑等物質，采用一系列可持續發展的農業技術，維持持續穩定的農業生產過程。有機產品是指根據有機農業原理和有機產品生產、加工標準生產出來的，經過有機產品認證機構認證的產品。

    近年來，我國有機產業發展迅速，目前，經國家認監委批準的有機產品認證機構有29個，按中國有機產品標準認證的企業有近2000家，有機認證面積達230萬公頃。我國有機產品種類主要有糧食、油料、蔬菜、水果、茶葉、蜂蜜、禽畜產品和水產品等。我國生產的有機產品出口到歐盟、美國、日本等國家和地區。

    二、無公害農產品認證

    無公害農產品，是指產地環境、生產過程和產品質量符合國家有關標準和規范要求，經認證合格獲得認證證書并允許使用無公害農產品標志的未經加工或者初加工的食用農產品。

    無公害農產品在生產過程中允許限量、限品種、限時間地使用人工合成的安全的化學農藥、獸藥、肥料、飼料添加劑等，符合國家的食品衛生標準。

    截至2006年底，全國共有獲得無公害農產品認證的單位14806個，產品23636個，產量達1.44億噸。

    無公害農產品認證作為一種基礎性的認證制度，國家財政每年都給予大量資金補貼，認證機構實施認證時不收取認證費用。

    三、HACCP認證

    HACCP是英文Hazard Analysis and Critical Control Point的縮寫，意為危害分析與關鍵控制點。國際標準CAC/RCP-1《食品衛生通則》1997修訂3版對HACCP的定義是：鑒別、評價和控制對食品安全至關重要的危害的一種體系。

    國家認監委于2002年發布實施《食品生產企業危害分析與關鍵控制點(HACCP)管理體系認證管理規定》和《出口食品衛生注冊需評審HACCP體系的產品目錄》，要求6類出口食品生產企業必須建立和實施HACCP體系，開展了HACCP官方驗證和第三方認證工作。

    截至2006年底，我國已有2287家食品出口企業通過出入境檢驗檢疫機構的HACCP管理機構驗證，2782家企業獲得第三方HACCP認證。

    四、良好農業規范（GAP）認證

    良好農業規范是強化農業生產經營管理行為，實現對種植、養殖全過程控制，從源頭上控制農產品質量安全的重要方式之一，已在越來越多的國家和地區推廣應用，在國際貿易中的作用也日益顯著。

    截至2006年底，我國累計發放良好農業規范認證證書45張。

    五、飼料產品認證

    飼料產品認證，是指企業自愿申請，認證機構對飼料和飼料添加劑產品及其生產過程按照有關標準或者技術規范要求進行的合格評定活動。飼料產品認證的對象，包括單一飼料、添加劑預混合飼料、濃縮飼料、配合飼料、精料補充料等飼料產品及營養性飼料添加劑和一般飼料添加劑等飼料添加劑產品。

    截至2006年底，共有60家企業產品通過了此認證，共發證155份。

    六、綠色食品認證

    綠色食品認證是上世紀90年代建立的一套認證制度。綠色食品是指遵循可持續發展原則，按照特定的生產方式生產，經專門機構認定，許可使用綠色食品標志商標的食品。綠色食品認證依據的是農業部綠色食品行業標準。

    截至2006年底，我國已發放綠色食品認證證書11346張。

    七、綠色市場認證

    “三綠工程”是國務院確定的確保食品安全的重要措施之一，其主要內容是“開辟綠色通道，建設綠色市場，倡導綠色消費”。

    截至2006年底，已發放綠色市場認證證書75張。認證對象包括：蔬菜批發市場、水果批發市場、肉禽蛋批發市場、水產品批發市場、糧油批發市場、調味品批發市場等專營批發市場和農副產品綜合批發市場；食品生鮮超市等專營農副產品的零售市場，以及大型綜合超市大賣場、倉儲式商場、便利店等兼營農副產品的零售場所。

    八、食品質量認證———酒類

    為建立我國統一的加工食品質量認證制度，國家認監委會同商務部于2005年9月制定、發布了《食品質量認證實施規則———酒類》，該規則對生產企業質量安全控制要求方面，借鑒了“國際食品安全行動計劃（GFSI）”中食品安全認證基準標準要求，對生產企業的GMP、GHP、HACCP提出了不同層次要求，對最終產品質量則按相關國家標準提出了要求，認證結果根據評審和檢測結果分為：一級、二級和優級。