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為保證有機產品的可追溯性，國家認監委要求認證機構在向獲得有機產品認證的企業發放認證標志或允許有機生產企業在產品標簽上印制有機產品認證標志前，必須按照統一編碼要求賦予每枚認證標志的一個唯一編碼，該編碼由17位數字組成，其中認證機構代碼3位、認證標志發放年份代碼2位、認證標志發放隨機碼12 ，并且要求在17位數字前加“有機碼”三個字。每一枚有機標志的有機碼都需要報送到“中國食品農產品認證信息系統”（網址http://food.cnca.cn），任何個人都可以在該網站上查到該枚有機標志對應的有機產品名稱、認證證書編號、獲證企業等信息。
（一）認證機構代碼（3位）
認證機構代碼由認證機構批準號后三位代碼形成。內資認證機構為該認證機構批準號的3位阿拉伯數字批準流水號；外資認證機構為：9+該認證機構批準號的2位阿拉伯數字批準流水號。
（二）認證標志發放年份代碼（2位）
采用年份的最后2位數字，例如2011年為11。
（三）認證標志發放隨機碼（12位）
該代碼是認證機構發放認證標志數量的12位阿拉伯數字隨機號碼。數字產生的隨機規則由各認證機構自行制定。
認證機構代碼由認證機構批準號后三位代碼形成。內資認證機構為該認證機構批準號的3位阿拉伯數字批準流水號；外資認證機構為：9+該認證機構批準號的2位阿拉伯數字批準流水號。
（二）認證標志發放年份代碼（2位）
采用年份的最后2位數字，例如2011年為11。
（三）認證標志發放隨機碼（12位）
該代碼是認證機構發放認證標志數量的12位阿拉伯數字隨機號碼。數字產生的隨機規則由各認證機構自行制定。
